O Colexio Santa Xoana de Lestonnac imparte na actualidade os seguintes  niveis educativos, todos eles concertados:

Educación Infantil      

- Para Alumnos e Alumnas de 3, 4 e 5 anos  (dúas clases por curso)

Educación Primaria        

- Primeiro Ciclo: 1º e 2º curso ( dúas clases por curso) 
- Segundo ciclo: 3º e 4º curso (dúas clases por curso) 
- Terceiro ciclo: 5º e 6º curso (dúas clases por curso)

ESO

- Primeiro ciclo: 1º e 2º curso (dúas clases por curso) 
- Segundo ciclo: 3º e 4º curso (dúas clases por curso)